록맨 에그제 시리즈의 외전격이자 스토리상 록맨 에그제와 록맨 에그제 2 사이에 있었던 일이다. RPG가 아닌 록맨 시리즈 특유의 횡방향 스크롤 형식으로 만든 게임이다. 록맨 에그제 시리즈 최초로 거치용 콘솔로 발매된 게임이기도 하다. 록맨 에그제의 히든 보스였던 섀도맨.EXE, 파라오맨.EXE은 스토리 보스로 등장하고 블루스.EXE, 포르테.EXE는 히든 보스로 등장하며, 1편의 파이어맨.EXE, 거츠맨.EXE, 컬러드맨.EXE, 일렉맨.EXE, 아이스맨.EXE과 2편의 퀵맨.EXE, 새로운 내비인 니들맨.EXE, 브라이트맨.EXE, 소드맨.EXE, 그래비티맨.EXE, 스타맨.EXE, 제로.EXE가 등장한다. 그리고 애니의 성우나 애니메이션 무인편의 오프닝이 가사없이 멜로디로 그대로 쓰였다.