제작사 : 스퀘어 등급 : 플렛폼: 플레이스테이션 발매일 : 1999.12.16 장르 : 액션,롤플레잉,어드벤처,호러 홈페이지 :
맨해튼 섬 봉쇄 사건 이후 3년.
전편의 사건 후 아야 브레어는 FBI의 산하 조직인 대 NMC 전문 기관 MIST에 NMC 헌터로 스카우트되어 경찰을 사직하였다.
네오 미토콘드리아 이브는 소멸시켰지만 NMC는 여전히 남아있고 미국 전역에서 NMC가 산발적으로 날뛰고 있어, 아야는 이러한 잔존 NMC의 추적을 계속하고 있다. 그렇다고는 해도 NMC를 생성시키는 네오 미토콘드리아는 더 이상 확인되지 않기에 NMC의 숫자는 착실히 감소해 멸절도 눈앞에 보일 정도가 되었다.
그러나 평온한 일상을 되찾는 날이 곧 올 거라고 믿고 있던 아야는 어떤 사건을 계기로 다시 그 참극의 기억에 시달리게 되는데...
조용히 숨쉬는 거대한 위기는 아무도 모르는 땅 속에서, 그렇지만 확실하게 이 어리석은 세상을 먹어치우기 시작했다.